ГОФРы....Что зависит от размера?

или чем чревата замена большего на меньший???

смотря в где стоит гофра и смотря на сколько меньше... если в разумных пределах - то ничем.

гофра выхлопной, перед катализатором, менше раза в три

Если меньше по длине в 3 раза - то это просто будет передаваться повыенная вибрация на хвостовую часть глушителя, что приведет к повышению нагрузки на резинки которыми крепиться глушитель + сократиться срок службы самой гофры.
Ну а если в диаметре в 3 раза меньше, то тут оно не пляшет никуда.